Главная страница
qrcode

Словарь терминов. Акцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона


Скачать 163,5 Kb.
НазваниеАкцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона
АнкорСловарь терминов.doc
Дата16.10.2017
Размер163,5 Kb.
Формат файлаdoc
Имя файлаСловарь терминов.doc
ТипДокументы
#33981
страница1 из 4
Каталог
  1   2   3   4

Словарь терминов

АКЦЕПТОРНАЯ ТОЧКА СПЛАЙСИНГА. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона.

АЛЛЕЛЬ. Одна из двух (или нескольких) альтернативных форм гена.

АЛЛЕЛЬНОЕ ИСКЛЮЧЕНИЕ. Экспрессия в лимфоците только одного аллеля, кодирующего иммуноглобулин.

АЛЛОСТЕРИЧЕСКИЙ КОНТРОЛЬ. Способность эффекторов при взаимодействии с одним участком фермента оказывать влияние на активность другого.

АМБЕР-КОДОН. Триплет UAG, один из трех бессмысленных кодонов, обуславливающих терминацию белкового синтеза.

АМБЕР МУТАЦИЯ. Любое изменение в ДНК, приводящее к появлению амбер-кодонов вместо триплета, кодирующего аминокислоту.

АМБЕР-СУПРЕССОРЫ. Мутантные гены, кодирующие тРНК с измененными антикодонами, способными узнавать кодон UAG. В некоторых случаях сохраняется способность узнавать исходный кодон.

АМИНОАЦИЛ-тРНК-СИНТЕТАЗЫ. Ферменты, осуществляющие ковалентное присоединение аминокислот к 2'- или 3'-ОН концам тРНК.

АМПЛИКАЦИЯ. Образование дополнительных копий хромосомных последовательностей, обнаруживаемых в хромосомной или внехромосомной ДНК.

АНТИГЕН. Чужеродная молекула, проникновение которой в организм вызывает синтез антитела (иммуноглобулина).

АНТИКОДОН. Триплет, занимающий определенное и постоянное положение в структуре молекулы тРНК; комплементарно взаимодействует с кодоном (или кодонами) мРНК.

АНТИТЕРМИНАТОРНЫЕ БЕЛКИ. Позволяют РНК-полимеразе продолжать транскрипцию, проходя определенные сайты терминации транскрипции.

АПОИНДУКТОР. Белок, взаимодействующий с ДНК для включения транскрипции РНК-полимеразой.

АССИМИЛЯЦИЯ ЦЕПИ. Способность RecA-белка обменивать одноцепочную ДНК но гомологичную цепь из дуплекса; за счет этого одноцепочная нить входит в состав дуплекса.

АТТЕНУАЦИЯ. Регуляция транскрипции на уровне терминации, осуществляемая при экспрессии некоторых бактериальных оперонов.

АТТЕНУАТОР. Терминаторная последовательность, на которой происходит аттенуация.

АУТОГЕННЫЙ КОНТРОЛЬ. Действие генного продукта, который либо подавляет (отрицательный аутогенный контроль), либо активирует (положительный аутогенный контроль) экспрессию своего собственного гена.

АУТОСОМЫ. Все хромосомы, кроме половых; в диплоидной клетке имеется по две копии каждой аутосомы.

АЦЕНТРИЧЕСКИЙ ФРАГМЕНТ. Фрагмент хромосомы, лишенный центромеры и поэтому теряющийся в процессе клеточного деления.

ALU-СЕМЕЙСТВО. Семейство гомологичных диспергированных последовательностей в геноме человека.

ALU-ГОМОЛОГИЧНОЕ СЕМЕЙСТВО. Семейство последовательностей в геномах млекопитающих, родственное Alu-семейтву человека.

АР-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ. Ферменты, разрезающие ДНК в апуриновых или апирамидиновых участках с образованием 5'-концов.

att-САЙТЫ. Участки фаговой и бактериальной хромосом, рекомбинация между которыми приводит к интеграции или исключению фага.

α-АМАНИТИН. Бициклический октапептид, получаемый из гриба Amanita phalloides; ингибирует транскрипцию определенных эукариотических РНК-полимераз, в особенности РНК полимеразы 2.
БАКТЕРИОФАГИ (ФАГИ). Вирусы, инфицирующие бактерии.

БЕЛКИ, ОСУЩЕСТВЛЯЮЩИЕ ПОЗИТИВНУЮ РЕГУЛЯЦИЮ. Необходимы для активации транскрипционной единицы.

БЕЛОК-РЕПРЕССОР. Способен связываться с оператором на ДНК или с РНК, предотвращая соответственно транскрипцию или трансляцию.

БИБЛИОТЕКА ГЕНОМА. Набор клонированных фрагментов ДНК, содержащий весь геном.

БЕССМЫСЛЕННАЯ МУТАЦИЯ. Изменения в ДНК, приводящее к замене смыслового кодона, соответствующего какой-либо аминокислоте, на бессмысленный (терминирующий).

БЕССМЫСЛЕННЫЙ КОДОН. Один из тех триплетов, UAG, UAA, UGA, вызывающих терминацию синтеза белка (UAG известен как amber-кодон, UAA - как ochre-кодон, UGA opal-кодон).

БИВАЛЕНТ. Структура, содержащая все четыре хроматиды (по две гомологичные пары); образуется в начальной стадии мейоза.

БЕЛОК ПРИБНОВА. Каноническая последовательность TATAATG, находящаяся на расстоянии около 10 п.н. перед стартовой точкой бактериальных генов. Представляет собой часть промотора, отвечающую за связывание РНК-полимеразы.

БЛОТТИНГ ДНК ПО САУЗЕРНУ. Процедура переноса денатурированной ДНК из агарозного геля на нитроцеллюлозный фильтр для гибридизации с комплементарным нуклеотидом.

БЛОТТИНГ РНК. Перенос РНК из агарозного геля на нитроцеллюлозный фильтр для последующей гибридизации с комплементарной ДНК.

БРЕШЬ (ПРОБЕЛ) В ДНК. Отсутствие одного или нескольких нуклеотидов.

БЫСТРО ЛИЗИРУЮЩИЕ (r) МУТАГЕНЫ. Мутагены Т-четных фагов, обуславливающие изменение зоны лизиса E.coli в конце инфекции.

БЫСТРО РЕАССОЦИИРУЮЩИЙ КОМПОНЕНТ. Последовательности ДНК, которые ренатурируют первыми; содержат высокоповторяющуюся ДНК.
ВВЕДЕНИЕ КОНЦЕВОЙ МЕТКИ. Методика введения радиоактивно меченой группы в один из концов (5' или 3') ДНК.

ВВЕДЕНИЕ МЕТКИ В ДНК ПРИ СМЕЩЕНИИ ОДНОЦЕПОЧНОГО РАЗРЫВА (ник-ТРАНСЛЯЦИЯ). Способность ДНК-полимеразы 1E.coli использовать разрыв в одной из цепей ДНК для того, чтобы начиная с него последовательно осуществить деградацию этой цепи, одновременно заменяя её новосинтеризированной; используется для введения в ДНК радиоактивно меченых нуклеотидов in vitro.

ВЕДУЩАЯ ЦЕПЬ. Цепь ДНК, синтезирующаяся непрерывно в 5'-3'-направлении.

ВЕКТОР ДЛЯ КЛОНИРОВАНИЯ. Любая плазмида или фаг, в которые может быть встроена чужеродная ДНК с целью клонирования.

ВЕРЕТЕНО. Структура, образующаяся в процессе деления эукариотической клетки; после растворения ядерной оболочки к веретену с помощью микротрубочек прикрепляются хромосомы.

ВИРУЛЕНТНЫЕ ФАГОВЫЕ МУТАНТЫ. Мутанты, неспособные лизогенизировать бактерии, и вызывающие их лизис.

ВИРУС-ПОМОЩНИК. Обладает функциями, отсутствующими у дефектного вируса, компенсирует их при смешанной инфекции.

ВОЗВРАТНОЕ СКРЕЩЕВАНИЕ. Скрещивание линии неизвестного генотипа с рецессивной гомозиготой. В таком скрещивании фенотип потомства определяется только хромосомами родителя с неизвестным генотипом.

ВСТАВКИ (ИНСЕРЦИИ). Обнаруживаются благодаря присутствия в ДНК дополнительных пар оснований.

ВЫБОРОЧНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ (salutatory replication). Побочная амплификация, приводящая к появлению большого количества копий какой-либо последовательности.

ВЫРЕЗАНИЕ. Процесс вырезания фага, эписомы или какой-либо иной последовательности ДНК из хромосомы «хозяина»; связан с их переходом в состояние автономно существующих молекул.

ВЫРОЖДЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА. Соответствие нескольких кодонов одной аминокислоте. Замена в третьем основании кодона не всегда приводит к замене аминокислоты.

ВЫСОКОПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ДНК. Компонент тотальной ДНК, который реассоциирует первым; идентичный сателлитной ДНК.

ВЫТЕСНЕНИЕ МЕТКИ (pulse-chase). Клетки непродолжительное время инкубируют с радиоактивно меченым предшественником (участвующим в каких-либо реакция или же являющимся предшественником ряда макромолекул); затем исследуют судьбу метки, продолжая инкубацию с немеченым предшественником.

ВЫТЕСНЕНИЕ ЦЕПИ. Характерный для ряда вирусов способ репликации ДНК, при котором синтезирующая цепь ДНК вытесняет прежнюю (гомологичную) цепь двухцепочечной молекулы.

v-ГЕН. Последовательность, кодирующая основную часть вариабельной (N-концевой) области иммуноглобулиновой цепи.
ГЕМЕТА. Половая клетка, содержащая гаплоидный набор хромосом.

НАПЛОИДНЫЙ НАБОР ХРОМОСОМ. Содержит по одной копии каждой аутосомы и одну половую хромосому; гаплоидное число хромосом (n) является характеристикой гамет.

ГАПТЕН. Небольшая молекула, присоединенная к инертному белковому носителю и выполняющая функцию антигена.

ГЕН (ЦИСТРОН). Фрагмент ДНК, участвующий в образовании полипептидной цепи; в его состав входят участки, расположенные перед кодирующей последовательностью и после нее (лидерная и концевая области), а также инсерционные последовательности (интроны).

ГЕННАЯ КОНВЕРСИЯ. Изменение одной из цепей гетеродуплексной ДНК, приводящее к комплементарности с другой цепью в тех положениях, где есть непарные основания.

ГЕНОМНЫЕ (ХРОМОСОМНЫЕ) КЛОНЫ ДНК. Последовательности геномной ДНК, клонированные в составе вектора.

ГЕНОТИП. Совокупность генов организма.

ГЕТЕРОГАМЕТНЫЙ ПОЛ. Пол характеризуется хромосомным набором 2A+XY.

ГЕТЕРОГЕННАЯ ЯДЕРНАЯ (ГЯ) РНК. Представлена продуктами транскрипции ядерных генов, осуществляемой РНК-полимеразой 2; эти транскрипты гетерогенны по размерам и обладают низкой стабильностью.

ГЕТЕРОДУПЛЕКСНАЯ (ГИБРИДНАЯ) ДНК. Образуется при спаривании одноцепочечных комплементарных ДНК из разных родительских дуплексов; возникает в процессе генетической рекомбинации.

ГЕТЕРОЗИГОТА. Особь с различными аллелями в каком-либо определенном локусе.

ГЕТЕРОМУЛЬТИМЕРНЫЕ БЕЛКИ. Состоят из различных субъединиц (кодируемых разными генами).

ГЕТЕРОХРОМАТИН. Генетически неактивные участки хромосом; постоянно находятся в конденсированном состоянии.

ГИБРИДИЗАЦИЯ. Процесс взаимодействия комплементарных цепей РНК и ДНК, образующих гибрид РНК-ДНК.

ГИБРИДИЗАЦИЯ В ЖИДКОЙ СРЕДЕ. Реакция между комплементарными цепями нуклеиновой кислоты, происходящая в растворе.

ГИБРИДИЗАЦИЯ В УСЛОВИЯХ НАСЫЩЕНИЯ. Гибридизация, проводимая в присутствии большого избытка одного из реагирующих компонентов. При этом все комплементарные последовательности другого компонента переходят в двухцепочечную форму.

ГИБРИДИЗАЦИЯ НА ФИЛЬТРАХ. Осуществляется путем инкубации препаратов денатутрированной ДНК, иммобилизованной на нитроцеллюлозном фильтре. с радиоактивно меченой РНК или ДНК.

ГИБРИДИЗАЦИЯ С КОЛОНИЯМИ. Метод гибридизации in situ, используемый для выявления бактериальных колоний, содержащих рекомбинантные плазмиды. которые несут фрагменты ДНК, гомологичные определенным последовательностям.

ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU. Реакция гибридизации между денатурированной ДНК клеток, раздавленных на предметном стекле микроскопа и меченной радиоактивными изотопами одноцепочечной РНК или ДНК; гибридизация обнаруживается благодаря последующей радиоавтографии.

ГИБРИДНЫЙ ДИСГЕНЕЗ. Неспособность определенных линий D. melanogaster скрещиваться между собой: образующиеся гибридные особи стерильны (хотя в остальном они могут быть фенотипически нормальными).

ГИБРИДОМА. Клеточная линия, образующаяся при слиянии клеток миеломы и лимфоцита; такая линия постоянно экспрессирует иммуноглобулины обоих родителей.

ГИПЕРХРОМИЗМ. Увеличение оптической плотности при денатурации ДНК.

ГИПЕРЧУВСТВИТЕЛЬНЫЕ К ДЕЙСТВИЮ ДНКазы 1 САЙТЫ. Небольшая область хроматина, определяемая по её повышенной чувствительности к ДНКазе 1 и другим нуклеазам; возможно, не содержит нуклеосом.

ГИПОТЕЗА КАЧАНИЙ. Объясняет способность тРНК узнавать более чем один кодон благодаря неканоническому (отличному от G-C, A-T) спариванию с третьим основанием кодона.

ГИРАЗА. Топоизомераза 2 типа из E.coli. Фермент способен вномить отрицетельные супервитки в ДНК.

ГИСТОНЫ. Эволюцеонно консервативные белки эукариот, связывающие ДНК; участвуют в формировании нуклеосомы, основной структурной субъединицы хроматина.

ГЛАВНЫЙ ЛОКУС ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ. Протяженная область хромосомы, содержащая большой кластер генов, кодирующих трансплантационные антигены и другие белки, обнаруживаемые на поверхности лимфоцитов.

ГОМОГАМЕТНЫЙ ПОЛ. Характеризуется хромосомным набором 2А+ХХ.

ГОМОЗИГОТА. Особь с одинаковыми аллелями в соответствующем локусе гомологичных хромосом.

ГОМОЛОГИ. Хромосомы, имеющие одинаковые генетические локусы; диплоидная клетка обладает двумя копиями каждого гомолога, по одной от каждого родителя.

ГОМОМУЛЬТИМЕРНЫЙ БЕЛОК. Состоит из идентичных субъединиц.

ГОРЯЧАЯ ТОЧКА. Участок, в котором частота возникновения мутаций (или рекомбинаций) очень велика.

ГРУППА КОМПЛЕМЕНТАЦИИ. Серия мутаций, относящихся к одной группе, не способных комплементировать друг друга в транс-конфигурации; они составляют генетическую единицу (цистрон), которую, может быть, лучше было бы назвать группой некомплементации.

ГРУППА СОВМЕСТИМОСТИ. Плазмиды, которые не могут существовать в одной и той же бактериальной клетке.

ГРУППА СЦЕПЛЕНИЯ. Включает все локусы, которые могут быть объединены (прямо или косвенно) на основании сцепленности; термин эквивалентен хромосоме.

G-ОКРАШИВАНИЕ ХРОМОСОМ. Метод специфического окрашивания метафазных хромосом; позволяет идентифицировать отдельные хромосомы гаплоидного набора.

G1. Период клеточного цикла между последним митозом и началом репликации ДНК.

G2. Период клеточного цикла после окончания репликации ДНК и до начала следующего митоза.
ДВУНАПРАВЛЕННАЯ РЕПЛИКАЦИЯ. Репликация, при которой две репликационные вилки движутся в противоположных направлениях от общего старта.

ДЕЛЕЦИИ. Удаление последовательности ДНК; области, фланкирующие удаленные участки, соединятся.

ДЕНАТУРАЦИЯ БЕЛКА. Переход из физиологической конформации в другую (неактивную) конформацию.

ДЕНАТУРАЦИЯ ДНК ЛИ РНК. Переход этих молекул из двухцепочечной формы в одноцепочечную; разделение цепей наиболее часто достигается нагреванием.

ДЕРЕПРЕССИРОВАННОЕ СОСТОЯНИЕ. То же самое что и индуцированное, если употребляется для описания нормального состояния гена. При описании эффекта мутаций имеет то же значение что и конститутивное.

ДИВЕРГЕНЦИЯ. Процент различий в нуклеотидных последовательностях двух ДНК или в аминокислотных последовательностях двух белков.

ДИСКИ. Участки политенных хромосом, имеющие вид плотных обозреваний. Содержат большое количество ДНК; представлены участками, задерживающими краситель при определенных химических обработках.

ДИПЛОИДНЫЙ НАБОР ХРОМОСОМ. Содержит по две копии каждой аутосомы и две половые хромосомы.

ДИЦЕНТРИЧЕСКАЯ ХРОМОСОМА. Образуется в результате объединения двух хромосомных фрагментов, каждый их которых содержит центромеру. Такая хромосома нестабильна и может быть разорвана в процессе митоза.

ДНК-ЗАВИСИМАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ. Гибридизация ДНК с РНК в условиях избытка ДНК.

ДОБРОВОЛЬНЫЕ ИНДУКТОРЫ. Напоминают истинные индукторы транскрипции, но не являются субстратами индуцируемых энзимов.

ДОМЕН В МОЛЕКУЛАХ БЕЛКА. Участок аминокислотной последовательности, связанный с определенной функцией.

ДОМИНАНТНЫЙ АЛЛЕЛЬ. Определяет фенотип гетерозиготы (в отличие от рецессивного аллеля).

ДОМЕН В ХРОМОСОМЕ. Может обозначать либо область, внутри которой суперспирализаций происходит независимо от других участков, или область, включающию в себя экспрессируемый ген и обладающую повышенной чувствительностью к ДНКазе 1.

D-ПЕТЛЯ Область внутри митохондриальной ДНК, в которой небольшой участок РНК взаимодействует с одной из цепей ДНК, вытесняя исходную комплементарную цепь. Этот же термин используется при описании события, катализиреумого RecA-белком, которое заключается в замене одной цепи ДНК другой одноцепочечной ДНК, захваченной извне.

dna-МУТАНТЫ БАКТЕРИЙ. Не способны синтезировать ДНК при 420С, но осуществляют этот процесс при 370С.
ЗАКРЫТАЯ РАМКА СЧИТЫВАНИЯ. Содержит кодоны преждевременной терминации, не позволяющие мРНК транслироваться в белок.

ЗАТРАВКА. Короткая последовательность (часто это РНК), комплементарно взаимодействующая с одной из цепей ДНК; образует свободный 3'-ОН-конец, используя который ДНК-полимераза начинает синтез дезоксирибонуклеотидной цепи.

ЗИГОТА. Оплодотворенная яйцеклетка; образуется в результате слияния двух гамет.
ИЗОАКЦЕПТОРНЫЕ тРНК. Молекулы тРНК, соответствующие одной и той же аминокислоте.

ИЗОТИП. Группа близкородственных иммуноглобулиновых цепей.

ИММУНИТЕТ ПРИ ЛИЗОГЕНИИ. Способность профага предотвращать развитие в бактерии другого фага того же типа.

ИММУНИТЕТ. Свойство профага препятствовать инфекции бактериальной клетки фагом того же типа; свойство плазмиды предотвращать размножение другой плазмиды того же типа. Эти свойства обусловлены различными механизмами. Кроме того, описана транспозиционная иммунность. Этот термин означает невозможность встраивания транспозона в ДНК, если в ней уже присутствует транспозон такого же типа.

ИНВЕРТИРОВАННЫЕ ПОВТОРЫ. Две копии одной и той же последовательности ДНК в составе одной молекулы, находящиеся в противоположной ориентации. Прилежащие друг к другу инвертированные повторы образуют палиндром.

ИНВЕНТИРОВАННЫЕ ТЕРМИНАЛЬНЫЕ ПОВТОРЫ. Близкие или идентичные короткие последовательности ДНК, находящиеся на концах некоторых транспозонов в противоположной ориентации.

ИНГИБИРОВАНИЕ КОНЕЧНЫМ ПРОДУКТОМ. Способность конечного продукта метаболического пути ингибировать активность фермента, катализирующего одну из ранних реакций этого процесса.

ИНДУКТОР. Небольшая молекула, включающая транскрипцию гена за счет связывания с регуляторным белком.

ИНДУКЦИЯ. Свойство клеток (бактериальных или дрожжевых) синтезировать определенные ферменты только при наличие соответствующих субстратов; применительно к экспрессии генов термин обозначает включение транскрипции в результате взаимодействия индуктора с регуляторным белком.

ИНДУКЦИЯ ПРОФАГА. Вырезание профага из генома клетки-хозяина, разрушение лизогенного репрессора и начало литического (инфекционного) цикла.

ИНДУКЦИРОВАННЫЕ МУТАЦИИ. Возникают под действием мутагенного фактора.

ИНТЕГРАЦИЯ. Внедрение вирусной или иной последовательности ДНК в геном клетки-хозяина, приводящее к ковалентному соединению с хозяйской последовательностью.

ИНТЕРФАЗА. Фаза клеточного цикла сежду митотическими делениями клетки; подразделяется на G1, S и G2.

ИНТРОН. Транскрибируемый участок ДНК, который удаляется из состава транскрипта при сплайсинге; в результате последовательности, находящиеся по обе стороны от интрона (экзаны), объединяются.
  1   2   3   4

перейти в каталог файлов


связь с админом