Главная страница
qrcode

Словарь терминов. Акцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона


Скачать 163,5 Kb.
НазваниеАкцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона
АнкорСловарь терминов.doc
Дата16.10.2017
Размер163,5 Kb.
Формат файлаdoc
Имя файлаСловарь терминов.doc
ТипДокументы
#33981
страница2 из 4
Каталог
1   2   3   4

IS. Это сокращение используется для обозначения инсерционной (вставочной) последовательности небольшого бактериального транспозона, кодирующего только генетические функции, необходимые для транспозиции.
КАНОНИЧЕСКАЯ (УСРЕДНЕННАЯ) ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ. Некая идеальная последовательность, каждая позиция в которой представлена нуклеотидом, наиболее часто встречающимся в реальных последовательностях.

КАПСИД. Внешняя белковая оболочка вирусной частицы.

КАТАБОЛИТНАЯ РЕПРЕССИЯ. Ослабление экспрессии многих бактериальных оперонов, происходящее при добавлении глюкозы; вызывается уменьшением уровня циклической АМР в клетке и инактивацией вследствие этого регуляторного САР-белка.

КАТЯЩЕЕСЯ КОЛЬЦО. Способ репликации, при котором репликационная вилка совершает множество оборотов на циркулярной матрице; синтезирующаяся в каждом цикле цепь ДНК вытесняет цепь, синтезированную в предыдущем цикле, образуя хвост, состоящий из линейного набора последовательностей, комплементарных одноцепочечному матричному кольцу.

кДНК. Одноцепочная ДНК, синтезированная in vitro путем обратной транскрипции; комплементарна РНК.

кДНК-КЛОН. Двухцепочечная ДНК, находящаяся в составе клонирующего вектора и соответствующая последовательности РНК.

КИНЕТИЧЕСКАЯ СЛОЖНОСТЬ. Сложность последовательностей некоторой фракции ДНК, определяемая по кинетики реассоциации.

КИНЕТОХОР. Особая структура в хромосоме, к которой прикреплены микротрубочки или митотическое веретено.

КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ. Последовательность событий, происходящих в клетке между двумя делениями.

КЛОН. Большое число клеток или молекул, идентичных одной родоначальной клетке или молекуле.

КОДИРУЮЩАЯ ЦЕПЬ. Та цепь ДНК, последовательность которой идентичная мРНК.

КОДОДОМИНАНТНЫЕ АЛЛЕЛИ. Аллели, совместно проявляющиеся в гетерозиготе. Ни один не доминирует над другим.

КОДОН. Триплет нуклеотидов, соответствующий определенной аминокислоте или терминирующему сигналу.

КОИНТЕГРАТ. Структура, образуемая при слиянии двух репликонов, только один из которых исходно содержит транспозон; в коинтеграте две копии транспозона расположены у границ соединения репликонов и ориентированы в одном направлении.

КОКОНВЕРСИЯ. Одновременная коррекция двух сайтов в процессе конверсии гена.

КОЛЬЦО БАЛЬБИАНИ. Гигантский пуф на политенной хромосоме.

КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ ЦЕПЬ. Одна из цепей ДНК, используемая в качестве матрицы для синтеза РНК и комплементарная ей.

КОМПЛЕМЕНТАЦИЯ. Способность независимых (неаллельных) генов, находящихся в тран-конфигурации детерминировать диффундирующие продукты, которые обуславливают появление дикого фенотипа.

КОНКАТЕМЕР ДНК. Образован из нескольких тандемно повторяющихся единиц генома.

КОНКАТЕНАТЫ. Кольцевые молекулы ДНК, соединенные между собой подобно кольцам в цепи.

КОНСЕРВАТИВНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ. Рекомбинация путем разрыва и последующего воссоединения существующих цепей ДНК без дополнительного синтеза новых участков.

КОНСТИТУТИВНЫЕ ГЕНЫ. Гены, экспрессия которых зависит только от взаимодействия РНК-полимеразы с с промотором и не регулируется дополнительными факторами; иногда так называют гены, слабо экспрессирующиеся во всех типах клеток.

КОНСТИТУТИВНЫЕ МУТАЦИИ. Приводят к тому, что гены, экспрессия которых регулируется, начинают экспрессироваться без какого-либо контроля.

КОНСТИТУТИВНЫЙ ГЕТЕРОХРОМАТИН. Конденсированное (биологически неактивное) состояние хроматина, содержащего неэкспрессирующиеся последовательности, обычно сателлитную ДНК.

КОНТРОЛИРУЮЩИЕ ЭЛЕМЕНТЫ. Подвижные элементы генома кукурузы, первоначально идентифицированные по их генетическим свойствам.

3'-КОНЦЕВАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ. Нетранслируемая последовательность на 3'-конце мРНК, следующая за терминирующем кодоном.

КООРДИНИРОВАННАЯ РЕГУЛЯЦИЯ. Означает общий контроль экспрессии группы генов.

КОРДИЦЕПИН. 3'-Дезоксиаденозин, ингибитор полиаденилирования РНК.

КОРЕПРЕСОР. Маленькая молекула, которая включает механизм репрессии транскрипции, связываясь с регуляторным белком.

КОР-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК. 146 нуклеотидных пар ДНК, находящихся в составе кор-частицы.

КОРРЕКЦИЯ. Любой механизм, исправляющий ошибки в процессе синтеза белка или нуклеиновой кислоты. Характерное свойство этого процесса – проверка правильности каждого компонента после его включения в полимерную цепь.

КОСМИДЫ. Плазмиды, содержащие встроенный cos-участок фага лямбда, благодаря чему плазмидная ДНК может быть упакована in vitro в оболочку фага.

КОР-ЧАСТИЦА. Продукт частичной нуклеазной деградации нуклеосомы, содержащий гистоновый октамер и 146 нуклеотидных пар ДНК; его структура сходна со структурой нуклеосомы.

КРЕСТООБРАЗНАЯ СТРУКТУРА. Структура ДНК, образуемая инвертированными повторами, при условии что комплементарное спаривание происходит между повторяющимися последовательностями, расположенными в одной цепи ДНК (в отличие от обычного комплементарного взаимодействия со своим партнером в другой цепи дуплекса).

КРИПТИЧЕСКИЙ САТЕЛЛИТ. Последовательность сателлитной ДНК, которая не обнаруживается в виде обособленного пика в градиенте плотности, т.е. этот сателлит не отделяется от основной полосы ДНК.

КРОССИНГОВЕР. Обмен материалом между гомологичными хромосомами, происходящий в процессе мейоза и лежащий в основе генетической рекомбинации.

КЭП. Структура на 5'-конце эукариотических мРНК; образуется после транскрипции за счет присоединения 5'-конца гуанинового нуклеотида к концевому основания мРНК. Эта структура может быть метилирована по крайней мере по той молекуле гуанина, которая присоединилась. Кэп имеет следующие строение 7MeG5'pp5'Np…
САР-БЕЛОК (БАК). Активируется циклицеской АМР и осуществляет позитивную регуляцию; необходим для инициации транскрипции РНК-полимеразой некоторых катаболит-чувствительных опероноы E. coli.

СААТ. Участок консервативной последовательности, расположенной примерно на расстоянии 75 пар оснований перед стартовой точкой в транскрипционных единицах эукариот; возможно, принимает участие в связывании РНК-полимеразы 2.

С0t. Основной параметр реакции реассоциации, вычисляемый как произведение концентрации ДНК на время инкубации в реакционной смеси.

C0t½. Значение С0t, характеризующее завершение реакции наполовину. Это значение прямо пропорционально общей длине уникальных последовательностей реассоциирующей ДНК.
ЛЕВАЯ ГРАНИЦА СПЛАЙСИНГА. Граница между правым концом экзона и левым концом интрона.

ЛЕТАЛЬНЫЙ ЛОКУС. Любой ген, в котором может быть получена летальная мутация.

ЛИГИРОВАНИЕ. Образование фосфодиэфирной связи между двумя основаниями одной цепи ДНК, разделенными разрывом. (Этот термин употребляют также в случае соединения тупых концов и при образовании связи в РНК.)

ЛИГИРОВАНИЕ ПО ТУПЫМ КОНЦАМ. Реакция соединения двух молекул двухцепочечной ДНК по концам, ни один из которых не выступает над другим.

ЛИДЕР. Нетранслируемая последовательность, находящаяся на 5'-конце мРНК и предшествующая инициирующему кодону.

ЛИЗИС. Разрушение бактериальных клеток в конце фагового инфекционного цикла, выход зрелых фаговых частиц.

ЛИЗОГЕНИЯ. Способность фага существовать в бактерии в виде профага, являющегося компонентом бактериального генома.

ЛИЗОГЕННАЯ БАКТЕРИЯ. Содержит в своем геноме профаг в репрессированном состоянии.

ЛИЗОГЕННЫЙ РЕПРЕССОР. Белок, блокирующий индукцию профага.

ЛИНКЕР. Синтетический, короткий двухцепочечный олигонуклеотид, содержащий сайты узнавания для ряда рестрикционных эндонуклеаз; может быть присоединен к концам фрагмента ДНК, полученного с помощью какой-либо другой реестрик тирующей эндонуклеазы, в процессе реконструирования рекомбинантной ДНК.

ЛИНКЕРНАЯ ДНК. ДНК нуклеосомы, выходящая за пределы кор-частицы (минимальной нуклеосомы) длиной 146 п.н.

ЛИПКИЕ КОНЦЫ. Комплементарные одноцепочечные участки ДНК, выступающие на противоположных концах двухцепочечной молекулы; возникают в результате ступенчатых разрезах в двухцепочечных молекулах ДНК.

ЛИТИЧЕСКАЯ ИНФЕКЦИЯ. Фаговая инфекция, заканчивающаяся разрушением бактериальных клеток и выходом фагового потомства.

ЛОКУС. Место в хромосоме, в котором картируется ген, отвечающий за определенный признак; локус может быть представлен любым аллелем данного гена.

LEAKY-МУТАЦИИ. Мутации, обуславливающие сохранение остаточного уровня экспрессии.

LTR (long terminal repeat). Длинные концевые повторы, находящиеся в прямой ориентации на обоих концах ДНК ретровируса.
МАЖОРНЫЕ мРНК. мРНК, представленные в клетке большим числом копий.

МАРКЕР (ДНК). Фрагмент ДНК известного размера, используемый для калибровки фрагментов в электрофоретическом геле.

МАРКЕР (ГЕНЕТИЧЕСКИЙ). Любой аллель, используемый в эксперименте.

МАТЕРИНСКОЕ НАСЛЕДОВАНИЕ. Предпочтительное проявление в потомстве генетических маркеров матери.

МЕДЛЕННЫЙ КОМПОНЕНТ В РЕАКЦИИ РЕАССОЦИАЦИИ. Компонент, который реассоциирует последним; обычно состоит из неповторяющейся ДНК.

МЕЖАЛЛЕЛЬНАЯ КОМПЛИМЕНТАЦИЯ. Изменение свойств гетеромультимерного белка в результате взаимодействия субъединиц, кодируемых двумя различными мутантными аллелями; гибридный белок может быть более или менее активен по сравнению с белком, состоящим из субъединиц только одного типа.

МЕЖДИСКИ. Менее плотные области политенных хромосом между дисками.

МЕЖЦИСТРОННАЯ ОБЛАСТЬ. Расстояние между терминирующем кодоном одного гена и инициирующим кодоном следующего гена в полицестронной транскрипционной единице.

МЕЙОЗ. Два последовательных деления клетки (1 и 2 мейотические деления), в результате которых исходное число хромосом 4n уменьшается до 1n в каждой из четырех образовавшихся клеток. Эти клетки созревают и превращаются в гаметы (сперматозоиды или яйцеклетки).

МЕТОД ОТПЕЧАТКОВ. Используется для обнаружения участка на молекуле ДНК, который связывается с некоторым белком. Этот прием основывается на том, что белки защищают последовательность ДНК, в области связывания от воздействия нуклеаз.

МЕТОД ПОЛУЧЕНИЯ УНИКАЛЬНОЙ ФРАКЦИИ ДНК. Состоит в получении неповторяющейся фракции ДНК путем гибридизации ДНК с РНК и последующей проверки гибридизованной ДНК в реакции реассоциации.

МЕТОД СЛУЧАЙНОГО РАЗРЕЗАНИЯ ГЕНОМА РЕСТРИКАЗАМИ (shotgum experiment). Клонирование всего генома в виде случайно образованных фрагментов.

МИГРАЦИЯ ВЕТВИ. Способность одноцепочечной ДНК, частично спаренной с комплементарной цепью в двухцепочечной молекуле ДНК, продолжать комплементарное взаимодействие и вытеснять гомологичную цепь из дуплекса.

МИЕЛОМА. Линия опухолевых клеток, происшедшая из лимфоцита, обычно продуцирует один тип иммуноглобулинов.

МИКРОКОККОВАЯ НУКЛЕАЗА. Эндонуклеаза, расщепляющая ДНК; при обработке этим ферментом хроматина гидролиз ДНК происходит преимущественно между нуклеосомами.

МИНИ-ХРОМАСОМА. Кольцевая ДНК (например, вирусов SV40 или полисомы) в нуклеосомной форме.

МИТОЗ. Деление эукариотической соматической клетки.

МНОЖЕСТВЕННОСТЬ мРНК. Среднее число молекул мРНК какого-либо одного вида на клетку.

МОДИФИКАЦИЯ ДНК ИЛИ РНК. Изменение нуклеотидов после их первоначального включения в полинуклеотидную цепь.

МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ОСНОВАНИЯ. Все основания, за исключением четырех канонических, из которых синтезируется ДНК (Т, С, А, G) или РНК (U, C, A, G); модифицированные основания появляются в результате изменения, возникающих в нуклеиновой кислоте после завершения её синтеза.

МОЗАИЧНЫЙ ФЕНОТИП. Образуется в результате мутации в соматических клетке в ходе развития.

МОЛЧАЩИЕ ГЕННЫЕ САЙТЫ. Такие точки в гене, мутации в которых не вызывают изменения продукта.

МОЛЧАЩИЕ МУТАЦИИ. Не изменяют продукта, кодируемого геном.

МОНОЦИСТРОННЫЕ мРНК. Кодируют один белок.

МУЛЬТИКОПИЙНЫЕ ПЛАЗМИДЫ. Присутствуют в бактериальных клетках в количестве более одной на хромосому.

МУЛЬТИМЕРНЫЕ БЕЛКИ. Состоят более чем из одной субъединицы.

МУТАГЕНЫ. Факторы, увеличивающие частоту возникновения мутаций, вызывая изменения в ДНК.

МУТАНТЫ С БЫСТРОЙ ОСТАНОВКОЙ СИНТЕЗА ДНК. dna-Мутанты E. coli, прекращающие репликацию сразу же после повышения температуры до 42ºС.

МУТАНТЫ С ЗАМЕДЛЕННОЙ ОСТАНОВКОЙ СИНТЕЗА ДНК. Мутанты dna E. coli, способные завершить начавшийся цикл бактериальной репликации, но не способные при 42ºС инициировать следующий раунд.

МУТАНТЫ С ОСЛАБЛЕННЫМ КОНТРОЛЕМ. Штаммы E. coli, неспособные к строгому ответу при голодании по аминокислотам (или другим питательным веществам).

МУТАЦИЯ. Любое изменение в последовательности ДНК.

МУТАЦИИ СДВИГА РАМКИ. Делеции или вставки, размеры которых не кратны трем основаниям, приводят к изменению рамки считывания при трансляции триплетов в белок.

МУТАЦИИ, УСИЛИВАЮЩИЕ ПРОМОТОР. Увеличивают частоты инициации транскрипции.
НЕИНДУЦИРУЕМЫЕ МУТАЦИИ. Мутации, которые не могут быть индуцированны.

НЕЙТРАЛЬНЫЕ ЗАМЕНЫ В БЕЛКЕ. Замены аминокислот, не связывающиеся на активности белка.

НЕПЕРМИССИВНЫЕ УСЛОВИЯ. Условия, не позволяющие выживать условно летальным мутантам.

НЕПОВТОРЯЮЩАЮСЯ ДНК. Характеризуется кинетикой реассоциации, свойственной уникальным последовательностям.

НЕПРЯМОЕ КОНЦЕВОЕ МЕЧЕНИЕ (indirect end labelling). Метод изучения ДНК, при котором производится разрез в определенном участке молекулы и выявляются все фрагменты, содержащие последовательность, располагающуюся только с одной от данного разреза; с помощью такого подхода определяют расстояние от данного разреза в молекуле ДНК до следующего.

НЕРАВНЫЙ КРОССИНГОВЕР. Рекомбинационное событие, при котором точки рекомбинации находятся не в идентичных локусах двух родительских молекул.

НЕРАСХОЖДЕНИЕ. Неспособность хроматида (дуплицированных хромосом) расходится к противоположным полюсам во время митоза или мейоза.

НЕСОВМЕСТИМОСТЬ. Невозможность совместного существования в одной клетке определенных бактериальных плазмид.

НЕТРАНСКРИБИРУЕМЫЙ СПЕЙСЕР. Область между транскрибируемыми единицами в генном кластере.

НУКЛЕОТИД. Компактное образование у бактерий, содержащее ДНК.

НУКЛЕОСОМА. Основная структурная единица хроматина, состоящая из ≈ 200 нуклеотидных пар ДНК и октамера гистоновых белков.

НУЛЕВАЯ ТОЧКА РЕАССОЦИАЦИИ ДНК. Дуплексы ДНК, существующие в самом реакции реассоциации.
ОБМЕН ЦЕПИ. Реакция, в которой одна из цепей двухцепочечной ДНК освобождается из дуплекса, образуя пару с комплементарной цепью другой молекулы, заменяя своего гомолога во втором дуплексе.

ОБРАТНАЯ МУТАЦИЯ. Мутация, которая восстанавливает дикий фенотип, снимая действие мутации, инактивировавшей ген.

ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПЦИЯ. Синтез ДНК на матрице РНК; осуществляется ферментом обратной транскриптазой.

ОБЯЗАТЕЛЬНЫЕ (ГЕНЫ «ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА»). Гены, кодирующие жизненно важные функции; экспрессируются в клетках всех типов.

ОДНОКОПИЙНЫЕ ПЛАЗМИДЫ. Плазмиды, присутствующие в бактериальной клетки в виде единственной копии.

ОДНОНАПРАВЛЕННАЯ РЕПЛИКАЦИЯ. Единственная репликационная вилка движется от определенной точки, называемой местом начала репликации.

ОПЕРАТОР. Участок ДНК, связываясь с которым белок-репрессор предотвращает инициацию транскрипции на прилежащем промоторе.

ОПЕРОН. Единица транскрипции и регуляции у бактерий, состоящая из структурных генов, регуляторного гена (генов) и контролирующих элементов, узнаваемых продуктами регуляторного гена.

ОСНОВНАЯ ПОЛОСА. Широкая полоса, образующаяся в градиенте плотности и состоящая из геномной ДНК, за исключением некоторых видимых сателлитных ДНК, формирующих отдельные полосы.

ОСТАНОВКАТРАНСЛЯЦИИ В РЕЗУЛЬТАТЕ ОБРАЗОВАНИЯ ГИБРИДА (Hybrid-arrested translation). Метод, позволяющий идентифицировать кДНК, соответствующую определенной мРНК. Основывается на том, что комплементарное взаимодействие кДНК с РНК ингибирует трансляцию этой РНК.

ОТКРЫТАЯ РАМКА СЧИТЫВАНИЯ. Состоит из ряда триплетов, кодирующих аминокислоты; не содержит каких-либо терминирующих кодонов; эта последовательность потенциально может транслироваться в белок.

ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ КОМПЛЕМЕНТАЦИЯ. Подавление активности субъединицы дикого типа в мультимерном белке мутантной субъединицей в результате межаллельной комплементации.

ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ. Введение в двухцепочечную ковалентную замкнутую ДНК супервитков, направление которых противоположно направлению витков цепей молекулы.

ОТСТАЮЩАЯ ЦЕПЬ. Должна удлиняться в 3' – 5' направлении, поэтому синтезируется прерывисто в виде коротких фрагментов (5' – 3'), которые затем ковалентно соединяются.

ОХРА-КОДОН. Триплет UAA, один из трех бессмысленных кодонов, вызывающих терминацию синтеза белка.

ОХРА-МУТАЦИЯ. Изменение в ДНК, приводящие к появлению UAA-кодона в сайте, первоначально занятом другим кодоном.

ОХРА-СУПРЕССОР. Ген, кодирующий мутантную тРНК, способную узнавать UAA-кодон, благодаря чему синтез белка может быть продолжен.


ПАЛИНДРОМ. Последовательность ДНК, которая остается неизменной, если на одной из цепей ДНК ее читать слева направо, а на другой справа налево; состоит из прилежащих друг к другу инвертированных поворотов.

ПАПОВАВИРУСЫ. Вирусы, инфицирующие животных, характеризующиеся небольшим геномом; к ним относятся вирус SV40 и вирус полиомы.

ПАРА ОСНОВАНИЙ (А – Т ИЛИ С – G). Являются партнерами в двойной цепи ДНК. Другие типы пар встречаются в определенных условиях в РНК.

ПЕРВИЧНЫЙ ТРАНСКРИПТ. Первоначально синтезированная не модифицированная молекула РНК, соответствующая транскрипционной единице.

ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ КЛАССА. Изменение экспрессии генов С-области иммуноглобулиновой цепи в процессе дифференцировки лимфоцита.
1   2   3   4

перейти в каталог файлов


связь с админом