Главная страница
qrcode

Словарь терминов. Акцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона


Скачать 163,5 Kb.
НазваниеАкцепторная точка сплайсинга. Участок между правым концом интрона и левым концом экзона
АнкорСловарь терминов.doc
Дата16.10.2017
Размер163,5 Kb.
Формат файлаdoc
Имя файлаСловарь терминов.doc
ТипДокументы
#33981
страница3 из 4
Каталог
1   2   3   4

ПЕРИОДИЧНОСТЬ ДНК. Число пар оснований, приходящихся на один виток спиральной молекулы ДНК.

ПЕРМИССИВНЫЕ УСЛОВИЯ. Позволяющие выживать условно летальным мутантам.

ПЕТИТ-ШТАММЫ. Мутанты дрожжей с нарушенной функцией митохондрии.

ПЕТЛЯ. Одноцепочечная область на конце шпильки, образующейся в РНК (или одноцепочечной ДНК); соответствует последовательности между инвертированными повторами в двухцепочечной ДНК.

ПЛАВЛЕНИЕ ДНК. Денатурация ДНК.

ПЛАЗМИДА. Кольцевая внехромосомная ДНК, способная к автономной репликации.

ПЛЕЙОТРОПИЯ. Способность гена оказывать влияние более чем на один признак (которые непосредственно не связаны между собой).

ПОБОЧНЫЙ СИНТЕЗ ДНК. Любой синтез ДНК в эукариотической клетке, происходящей вне S-фазы.

ПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ДНК. Ведет себя в реакции реассоциации так, как если бы большое количество копий последовательностей (похожих или идентичных) данной ДНК присутствовало в образе, что позволяет любой паре комплементарных последовательностей реассоциировать.

ПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ЕДИНИЦА. Длина повторяющейся последовательности тандемного кластера. Ее рестрикционная карта выглядит аналогично рестрикационной карте кольцевой молекулы ДНК.

ПОЗДНЯЯ СТАДИЯ. Период инфекционного цикла фага после начала репликации ДНК.

ПОЛИАДЕНИЛИРОВАНИЕ. Присоединение последовательности полиаденилиновой кислоты к 3'-концу эукариотической РНК после завершения ее синтеза.

ПОЛИМОРФИЗМ. Одновременное существование популяции нескольких аллельных вариантов какого либо гена; обнаруживается либо по различию в фенотипах, соответствующих разным аллелям, либо по характеру рестрикции ДНК, несущей разные аллели.

ПОЛИПЛОИДНАЯ КЛЕТКА. Содержит более чем два гаплоидных набора хромосом.

ПОЛИПРОТЕИН. Продукт трансляции; расщепляется на несколько отдельных белков.

ПОЛИСОМА (ПОЛИРИБОСОМА). мРНК, ассоциированная с несколькими рибосомами, участвующими в трансляции.

ПОЛИТЕННЫЕ ХРОМОСОМЫ. Образуются в результате последовательных репликации хромосом без их последующего расхождения.

ПОЛОВЫЕ ХРОМОСОМЫ. Хромосомы, различающиеся у двух полов. Обычно такие хромосомы обозначаются как X и Y (или W и Z), один пол имеет XX- или WW-набор, другой – XY- или WZ-набор.

ПОЛУКОНСЕРВАТИВНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ. Осуществляется за счет разделения цепей исходной двухцепочечной молекулы и последующего использования каждой из них в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи.

ПОЛУПРЕРЫВИСТАЯ РЕПЛИКАЦИЯ. Одна из цепей синтезируется непрерывной, тогда как другая в виде фрагментов.

ПОЛЯРНОСТЬ. Влияние мутации, возникающей в каком-либо гене, на экспрессию (на транскрипционном или трансляционном уровне) генов, расположенных в той же транскрипционной единице.

ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ШАЙНА-ДАЛЬГАРНО. Вся или только часть полипуриновой последовательности AGGAGG, находящейся на мРНК непосредственно перед инициирующим AUG-кодоном, комплементарна последовательности на З'-конце 16S-pPHK; принимает участие в связывании рибосомы с мРНК.

ПРАВИЛО GT-АG. Данные динуклеотиды всегда присутствуют в первых двух и последних двух положениях нитронов, входящих в состав ядерных генов.

ПРАЙМОСОМА. Комплекс белков, принимающих участие в инициировании синтеза фрагментов Оказаки в процессе прерывистой репликации ДНК; праймосома может перемещаться вдоль ДНК, участвуя в последующих актах инициации.

ПРЕРЫВИСТАЯ РЕПЛИКАЦИЯ. Осуществление синтеза ДНК путем образования коротких фрагментов (Оказаки), которые затем соединяются в единую нить.

ПРОВИРУС. Двухцепочечная последовательность ДНК, встроенная в хромосому эукариот и соответствующая геномной РНК ретровирусов.

ПРОГУЛКА ПО ХРОМОСОМЕ (chromosome walking). Термин означает последовательное выделение клонов, содержащих перекрывающиеся фрагменты ДНК. С помощью такого подхода можно картировать ДНК.

ПРОКАРИОТЫ. Организмы (бактерии), не имеющие ядра.

ПРОМЕЖУТОЧНЫЕ (ВСТАВОЧНЫЕ) ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ (intervening sequence). Такие последовательности называются интронами.

ПРОМОТОР. Участок ДНК, ответственный за связывание РНК-полимеразы, инициирующей транскрипцию.

ПРОСТАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК. Понятие, эквива­лентное сателлитной ДНК.

ПРОФАГ. Фаговый геном, интегрированный в бактериаль­ную хромосому.

ПРЯМЫЕ МУТАЦИЙ. Инактивируют ген дикого типа.

ПРЯМЫЕ ПОВТОРЫ. Идентичные (или похожие) последо­вательности, присутствующие в двух или более копиях, одинако­во ориентированные, находящиеся на одной молекуле ДНК; примыкание друг к другу необязательно.

ПСЕВДОГЕНЫ. Неактивные, но стабильные элементы гено­ма, возникшие в результате мутаций в ранее работающем гене.

ПУФ. Необычайное увеличение диска на политенной хромо­соме, связанное с активным синтезом РНК в каком-то локусе этого диска.

pBR322. Один из стандартных плазмидных векторов, исполь­зуемых при клонировании.
РАДИОАВТОГРАФИЯ. Обнаружение радиоактивно меченных молекул по их способности оставлять след на фотографической пленке.

РАДИОАКТИВНЫЙ СВИДЕТЕЛЬ. Радиоактивно меченный компонент нуклеиновой кислоты, включаемый в реакцию реас­социации в очень малых количествах, не влияющих на дальней­шее протекание реакции.

РАЗРЫВ В ДУПЛЕКСЕ ДНК. Отсутствие фосфодиэфирной связи между двумя соседними нуклеотидами в одной из цепей двухцепочечной ДНК.

РАЗРЫВ И ВОССОЕДИНЕНИЕ. Тип генетической рекомбина­ции, при котором две молекулы двухцепочечной ДНК разры­ваются в соответствующих точках и затем соединяются крест- накрест.

РАМКА СЧИТЫВАНИЯ. Один из трех возможных способов считывания нуклеотидной последовательности в виде последо­вательного ряда триплетов.

РАННЯЯ СТАДИЯ. Период фаговой инфекции до начала репликации ДНК.

РАСКРУЧИВАНИЕ ДНК. Процесс, происходящий в результа­те отрицательной суперспирализации (так как сама двойная цепь закручивается в направлении, противоположном спирали- зации нитей ДНК).

РАСПОЛОЖЕНИЕ ПРОТИВ ХОДА ТРАНСКРИПЦИИ (downstream). Условное обозначение расположения последова­тельностей в направлении, противоположном направлению экспрессии; например, бактериальный промотор находится про­тив хода транскрипции от транскрипционной единицы, а ини­циирующий кодон находится против хода транскрипции от ко­дирующей области.

РАССТОЯНИЕ ПО КАРТЕ. Измеряется в сМ (сантиморгани- дах), соответствует проценту рекомбинаций.

РАСХОДЯЩАЯСЯ ТРАНСКРИПЦИЯ. Транскрипция с двух промоторов в противоположных направлениях.

РАСХОЖДЕНИЕ ХРОМОСОМ. Перемещение членов гомоло­гичной пары хромосом к противоположным полюсам во время клеточного деления. При митозе и втором мейотическом деле­нии этот термин употребляется по отношению к сестринским хроматидам; при первом мейотическом делении он применим к парам сестринских хроматид.

РЕАКЦИЯ, ПРОИСХОДЯЩАЯ ВХОЛОСТУЮ (idling reaction). Образование рибосомами pppGpp и ppGpp, когда незаряжен­ная тРНК находится в участке А; определяет возможность строгого ответа.

РЕАССОЦИАЦИЯ ДНК. Взаимодействие комплементарных цепей с образованием двухцепочечной спирали.

РЕВЕРСИЯ МУТАЦИИ. Замена в ДНК, которая или исправ­ляет первоначальное повреждение (истинная реверсия) или компенсирует его (в результате вторичной мутации в данном гене).

РЕВЕРТАНТЫ. Клетки или организмы, у которых произош­ла реверсия мутации.

РЕГУЛЯТОРНЫЙ ГЕН. Кодирует РНК или белок, чья функ­ция состоит в контроле экспрессии других генов.

РЕДКО ВСТРЕЧАЮЩАЯСЯ мРНК. Фракция мРНК, состо­ящая из большого числа индивидуальных видов мРНК, каж­дая из которых присутствует только в нескольких копиях на клетку.

РЕЗОЛВАЗА. Фермент, обеспечивающий сайтспецифическую рекомбинацию между двумя транспозонами, находящимися в виде прямых повторов в коинтегратных молекулах.

РЕКОМБИНАЦИОННАЯ РЕПАРАЦИЯ. Способ залечивания бреши в одной из цепей двухцепочечной ДНК за счет замеще­ния участком гомологичной цепи из другой молекулы.

РЕКОМБИНАЦИОННЫЕ  УТОЛЩЕНИЯ           (УЗЕЛКИ)

(recombination nodules). Плотные образования, присутствующие в составе синаптического комплекса; возможно имеют от­ношение к кроссинговеру.

РЕНАТУРАЦИЯ. Реассоциация денатурированных компле­ментарных цепей ДНК с образованием двухцепочечной моле­кулы.

РЕПЛИКАЦИОННАЯ ВИЛКА. Точка, в которой цепи роди­тельской двухцепочечной ДНК расходятся для того, чтобы мо­гла произойти репликация.

РЕПЛИКАЦИОННЫЙ ГЛАЗОК. Область реплицирующейся ДНК внутри протяженного нереплицирующегося района.

РЕПЛИКОН. Единица генома, способная к автономной репликации ДНК; содержит точку инициации реплика­ции.

РЕПЛИСОМА. Мультиферментный комплекс, формирую­щийся в бактериальной репликационной вилке для осуществле­ния синтеза ДНК. Содержит ДНК-полимеразу и ряд других белков.

РЕПРЕССИЯ. Ингибирование транскрипции (или трансля­ции) за счет связывания белка репрессора со специфическим сай­том на ДНК (или мРНК).

РЕСТРИКЦИОННАЯ КАРТА. Линейная последовательность сайтов, в которых ДНК расщепляется различными рестриктаза- ми.

РЕТРОВИРУС. РНК-содержащий вирус, цикл размножения которого проходит через стадию двухцепочечной ДНК.

РЕТРОРЕГУЛЯЦИЯ. Способность дистально расположенной последовательности мРНК регулировать ее трансляцию.

РЕЦЕССИВНО ЛЕТАЛЬНЫЙ АЛЛЕЛЬ. Аллель, летальный в гомозиготном состоянии.

РЕЦЕССИВНЫЙ АЛЛЕЛЬ. Не проявляющийся в гетерозиготе. Отсутствие проявления обусловлено инактивацией или от­сутствием продукта рецессивного аллеля.

РЕЦИПРОКНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ. Образование новых ге­нотипов с противоположным расположением аллелей по сравне­нию с их организацией у матери или отца.

РИФАМИЦИНЫ. Группа антибиотиков, ингибирующих транскрипцию у бактерий.

РНК-ЗАВИСИМАЯ ГИБРИДИЗАЦИЯ. Реакция гибридизации, проводимая в условиях избытка РНК. Этот тип гибридизации используется в тех случаях, когда необходимо, чтобы все ком­плементарные последовательности одноцепочечной ДНК уча­ствовали в реакции.

мя-РНК (МАЛАЯ ЯДЕРНАЯ РНК). Одна из многих ма­леньких РНК, содержащихся в ядре; ее функция неясна, возмож­но, принимает участие в сплайсинге.

РОДСТВЕННЫЕ тРНК. Молекулы тРНК, которые узнаются определенной аминоацил-тРНК—синтетазой.

R-ПЕТЛЯ. Структура, образующаяся при гибридизации РНК с комплементарной цепью двухцепочечной ДНК; при этом про­исходит вытеснение исходной цепи ДНК в виде петли, располо­женной в области гибридизации.

RecA-БЕЛОК. Кодируется гесА-локусом Е. coli; обладает дву­мя активностями: функционирует как протеаза и участвует в об­мене цепей между различными молекулами ДНК. Протеазная активность контролирует SOS-функцию; нуклеиновые кислоты благодаря этому белку участвуют в процессах рекомбинации и репарации.

ρ-НЕЗАВИСИМЫЕ ТЕРМИНАТОРЫ. Последовательности ДНК, на которых РНК-полимераза прекращает транскрипцию в отсутствие р-фактора.

ρ-ФАКТОР. Белок, помогающий РНК-полимеразе прекра­щать транскрипцию в определенных (р-зависимых) сайтах.
САЙТСПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ. Происходит ме­жду двумя определенными (не обязательно гомологичными) по­следовательностями, например наблюдается при интеграции и исключении фага или при разрешении коинтегратных структур в процессе транспозиции.

САЙТЫ ЗАМЕЩЕНИЯ. Сайты в гене, мутации в которых приводят к замене кодируемой аминокислоты.

САМОКОМПЛЕМЕНТАРНАЯ ДНК. Состоит из обращенных повторов, которые ренатурируют за счет реассоциации компле­ментарных последовательностей, расположенных на одной цепи в денатурированной ДНК.

САТЕЛЛИТНАЯ ДНК. Состоит из большого числа тан­демных повторов (идентичных или похожих) основной короткой последовательности.

СУПЕРВИТКИ В ДНК. Образуются в результате супер­спирализации ДНК; способствуют дальнейшему закручиванию двух цепей дуплекса относительно друг друга.

СЕЛЕКЦИЯ. Создание условий, при которых выживает толь­ко определенный тип клеток.

СЕСТРИНСКИЕ ХРОМАТИДЫ. Копии хромосомы, образую­щиеся при ее репликации.

СИГМА-ФАКТОР. Субъединица бактериальной РНК-полиме- разы, необходимая для инициации; влияет преимущественно на выбор сайтов связывания (промоторов).

СИГНАЛЬНАЯ ГИПОТЕЗА. Объясняет необходимость N-кон­цевой последовательности секретируемых белков для прикреп­ления новообразованного полипептида к мембране; согласно гипотезе, мРНК и рибосома прикрепляются к мембране в про­цессе синтеза белка благодаря его N-концевой части.

СИНАПСИС. Конъюгация двух пар сестринских хроматид гомологичных хромосом, происходящая во время мейоза; обра­зующаяся структура называется бивалентом.

СИНАПТОНЕМАЛЬНЫЙ КОМПЛЕКС. Структура, возникаю­щая при конъюгации хромосом.

СИНТЕННЫЕ ЛОКУСЫ. Генетические локусы, относящиеся к одной и той же хромосоме.

СЛОЖНОСТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК. Суммарная длина уникальных последовательностей ДНК данного препара­та.

СЛОЖНЫЕ ТРАНСПОЗОНЫ. Центральная часть таких транспозонов фланкирована инсерционными последовательно­стями, которые и обусловливают способность к транспозиции.

СЛОЖНЫЙ ЛОКУС. Локус (например, у D. melanogaster), ге­нетические свойства которого не согласуются с принципом «один ген-один белок».

СОГЛАСОВАННАЯ ЭВОЛЮЦИЯ. Означает, что два род­ственных гена эволюционируют совместно, как если бы они от­носились к одному локусу.

СОМАТИЧЕСКИЕ КЛЕТКИ. Все клетки организма, за исклю­чением половых клеток.

СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫЕ ГЕНЫ (ГЕНЫ «РОСКОШИ»), Гены, кодирующие белки, синтезирующиеся (обычно) в больших коли­чествах в клетках определенных типов.

СПЛАЙСИНГ. Процесс удаления интронов и объединения экзонов в мРНК.

СПОНТАННЫЕ МУТАЦИИ. Возникают в отсутствие каких- либо факторов, увеличивающих частоту мутирования.

СПОРУЛЯЦИЯ. Образование бактериальных (в результате изменения морфологии) или дрожжевых (в результате мейоза) спор.

СТАРТОВАЯ ТОЧКА (ИНИЦИИРУЮЩИЙ САЙТ). Обозначает участок ДНК, соответствующий первому основанию, включаю­щемуся в РНК.

СТЕБЕЛЬ. Двухцепочечный участок шпильки, образованный спаренными основаниями.

СТЕПЕНЬ СКРУЧЕННОСТИ. Число раз, которое ось двойной спирали пересекает саму себя в пространстве.

СТРЕПТОЛИДИГИНЫ. Группа антибиотиков, ингибирующих элонгацию транскрипции, осуществляемую бактериальной РНК- полимеразой.

СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ РЕПЛИКАЦИИ. Ограничение реплика­ции однокопийных плазмид, согласованное с репликацией бакте­риальной хромосомы.

СТРОГИЙ ОТВЕТ. Способность бактерии прекращать синтез тРНК и образование рибосом в голодной среде.

СТРУКТУРА ТИПА ВОСЬМЕРКИ. Образуется из двух замк­нутых молекул ДНК, сцепленных вместе в результате рекомби­национных событий, которые полностью не завершились.

СТРУКТУРНЫЙ ГЕН. Кодирует РНК или белок.

СТУПЕНЧАТЫЕ РАЗРЕЗЫ. Возникают в двухцепочечиой ДНК, в том случае, когда ее цепи расщепляются в точках, нахо­дящихся недалеко друг от друга.

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ. Означает закручивание кольцевой двухцепочечиой ДНК в пространстве таким образом, что при этом она пересекает собственную ось дуплекса.

СУПРЕССИЯ. Изменения, которые устраняют проявление мутации, не исправляя при этом первоначального нарушения в ДНК.

СУПРЕССОР (ВНЕГЕННЫЙ). Обычно ген, кодирующий му- тантную тРНК, которая прочитывает мутантный кодон соглас­но значению первоначального кодона или включает похожую аминокислоту.

СУПРЕССОР (ВНУТРИГЕННЫЙ). Компенсирующая мутация, восстанавливающая первоначальную рамку считывания.

СУПРЕССОР БЕССМЫСЛЕННОГО КОДОНА. Ген, кодирую­щий мутантную тРНК, способную узнавать бессмысленный кодон.

СЦЕПЛЕННОСТЬ. Свойство генов одной хромосомы насле­доваться совместно; измеряется в процентах рекомбинации между локусами.

СЦЕПЛЕНИЕ С ПОЛОМ. Способ наследования, характерный для генов, находящихся в половых хромосомах (обычно в Х-хромосоме).

СФЕРОПЛАСТ. Бактериальная или дрожжевая клетка, лишенная или почти лишенная клеточной стенки.

S-ФАЗА. Период клеточного цикла, в течение которого происходит синтез ДНК в эукариотической клетке.

S1-НУКЛЕАЗА. Фермент, который специфично деградирует неспаренные (одноцепочечные) последовательности ДНК.

SOS-БЛОК. Последовательность ДНК (оператор) длиной около 20 п.н., узнаваемая белком-репрессором LexA.

SОS-ОТВЕТ. Координированная индукция синтеза многих ферментов, в том числе и репарационных, в ответ на радиационное или иное повреждение ДНК у E. coli; является следствием активации протеазной активности RecA-белка расщепляющей LexA-репрессор.

SSB-БЕЛОК. Белок E. coli, связывающийся с одноцепочечной ДНК.
ТАЛАССЕМИЯ – заболевание человека, вызванное отсутствием α- или β-глобина в его эритроцитах.

ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ. Множественные копии одинаковых последовательностей, расположенных одна за другой, ориентированных в одном направлении.

ТЕЛОМЕРА. Естественный конец хромосомы.

ТЕМПЕРАТУРА ПЛАВЛЕНИЯ (Тпл). Соответствует среднему значению температурного интервала, в пределах которого происходит плавление ДНК.

ТЕМПЕРАТУРОЧУВСТВИТЕЛЬНЫЙ МУТАНТ. Не способен развиваться при повышенной температуре.

ТЕРМИНАЛЬНАЯ ИЗБЫТОЧНОСТЬ. Повторение одних и тех же последовательностей на обоих концах, например, хромосомы фага.

ТЕРМИНАТОР. Последовательность ДНК, находящаяся на конце транскрипта и ответственная за прекращение транскрипции.

ТЕРМИНИРУЮЩИЕ (ОСВОБОЖДАЮЩИЕ) ФАКТОРЫ. Узнают бессмысленные кодоны, вызывая освобождение синтезированной полипептидной цепи и рибосом от мРНК.

ТЕРМИНИРУЮЩИЙ КОДОН. Один из трех триплетов UAG (amber), UAA (ochre) или UGА, вызывающих терминацию синтеза белка; их также называют бессмысленными кодонами.

ТЕСТ НА КОМПЛЕМЕНТАЦИЮ IN VITRO. Наличие в клетках дикого фенотипа такого компонента, который восстанавливает исходную активность в экстракте, приготовленном из мутантных клеток.

1   2   3   4

перейти в каталог файлов


связь с админом